آگاروز کد a9539 سیگما
آگاروز کد A9539 سیگما آلدریچ (Sigma-Aldrich Agarose)، یک پلی ساکارید خطی با خلوص استاندارد و گرید بیولوژی مولکولی است که به عنوان ژل پایه در تفکیک، آنالیز و خالص سازی اسیدهای نوکلئیک (DNADNADNA و RNARNARNA) و پروتئین ها کاربرد دارد. این گرید آگاروز به طور ویژه برای آزمایش های روزمره و روتین آزمایشگاهی بهینه سازی شده و به دلیل درصد بسیار پایین ناخالصی های باردار، کمترین میزان پس زمینه (Background) را در رنگ آمیزی با رنگ های فلورسنت ایجاد می کند.
ماتریس متخلخل تشکیل شده توسط آگاروز A9539 تفکیک دقیق قطعات اسید نوکلئیک در محدوده ۱۰۰ جفت باز تا بیش از ۲۰ کیلوجفت باز را با وضوح باند بسیار بالا فراهم می سازد.
| پارامتر فنی و آنالیز | مقدار / تعریف استاندارد | اهمیت بیوشیمیایی |
|---|---|---|
| نام محصول | آگاروز روتین (Agarose for routine use) | معرف پایه الکتروفورز بیولوژی مولکولی |
| کد محصول سیگما | A9539 | شناسه سفارش رسمی سیگما آلدریچ |
| شماره ثبت CAS | 9012-36-6 | شناسه استاندارد بین المللی آگاروز |
| شماره EC Number | 232-731-8 | شناسه رجیستری اروپا |
| میزان سولفات (Sulfate Content) | بسیار پایین (شاخص خلوص بالا) | کاهش تداخل گروه های یونی با اسیدهای نوکلئیک |
| الکترواندواسمز (EEO) | استاندارد و کنترل شده | جلوگیری از جریان معکوس مایع به سمت کاتد |
| استحکام ژل (Gel Strength) | مقاومت بالا در برابر شکست | سهولت در جابجایی ژل و برش باندها بدون پارگی |
| نقطه تشکیل ژل (Gel Point) | دمای انتقال سل به ژل حین سرد شدن | دارای رفتار هیسترزیس نوری و حرارتی نسبت به نقطه ذوب |
| وضوح فلورسانس | پس زمینه حداقل (Low Background) | سازگاری کامل با Ethidium Bromide و SYBR Green |
| بسته بندی های استاندارد | ۱۰، ۲۵، ۵۰، ۱۰۰، ۲۵۰ و ۵۰۰ گرمی | بطری پلی اتیلنی مقاوم به رطوبت |
کیفیت تفکیک قطعات ژنتیکی در این آگاروز بر اساس چهار پارامتر بیوفیزیکی تعریف می شود:
سولفات اصلی ترین گروه ناخالصی آنیونی در آگارز طبیعی است. در آگاروز A9539، مقدار سولفات به حداقل رسیده است. هر چه میزان سولفات کمتر باشد، خلوص پلیمر بالاتر بوده و اتصال غیر اختصاصی به اسیدهای نوکلئیک یا مهار آنزیم های پایین دست (مانند لیگازها و پلیمرازها) رخ نمی دهد.
در میدان الکتریکی، گروه های باردار منفی متصل به ماتریس آگاروز ثابت می مانند، در حالی که کاتیون های محلول به همراه پوسته هیدراته خود به سمت کاتد حرکت می کنند. این جریان مایع داخلی (EEO) می تواند حرکت طبیعی DNA به سمت آند را کند یا ناهموار کند. مقدار کنترل شده EEO در کد A9539 تضمین کننده حرکت صاف و مستقیم باندها است.
استحکام ژل نشان دهنده مقدار نیروی فیزیکی بر حسب گرم بر سانتی متر مربع است که ژل بدون شکست ساختاری تحمل می کند. این ویژگی باعث می شود حتی در غلظت های پایین (مانند ژل ۰.۷ یا ۰.۸ درصد)، ژل حین انتقال به تانک یا مرحله برش باند (Gel Extraction) پاره نشود.
آگاروز رفتار حرارتی منحصر به فردی دارد؛ دمایی که در آن محلول آگاروز هنگام سرد شدن شبکه ژلی تشکیل می دهد (Gel Point) به مراتب پایین تر از دمایی است که ژل دوباره ذوب می شود (Melting Point). این ویژگی زمان کافی برای ریختن ژل در سینی کستینگ را بدون انجماد ناگهانی فراهم می کند.
| ویژگی مقایسه ای | آگاروز روتین (Sigma A9539) | آگاروز با نقطه ذوب پایین (Low Melting Point) | آگاروز با تفکیک بالا (High Resolution) |
|---|---|---|---|
| کاربرد اصلی | الکتروفورز ژل عمومی DNA و RNA، بلاتینگ | استخراج آنزیمی درون ژل، کلونینگ درجا | تفکیک قطعات بسیار کوچک (زیر ۱۰۰۰ جفت باز) |
| دمای ذوب | استاندارد (حدود ۸۸ تا ۹۰ درجه سانتی گراد) | پایین (کمتر از ۶۵ درجه سانتی گراد) | متوسط تا بالا |
| استحکام مکانیکی | بالا و مناسب استفاده روزانه | شکننده و نیازمند کار با دقت بالا | بسیار متراکم |
| میزان پس زمینه فلورسانس | بسیار کم در رنگ آمیزی روتین | بسیار کم | کم |
| مقرون به صرفه بودن | بسیار اقتصادی برای کاربری روزمره آزمایشگاهی | قیمت بالاتر به دلیل فرآوری هیدروکسی اتیل | قیمت بالا برای تفکیک های دقیق شبیه پلی آکریل آمید |
جداسازی محصولات واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR)، هضم آنزیمی وکتورها و بررسی یکپارچگی نمونه های استخراج شده DNA ژنومیک و پلاسمید و RNA.
انتقال کارآمد باندهای ژنتیکی تفکیک شده از ژل به غشاهای نایلونی یا نیتروسلولز با حفظ وضوح فضایی قطعات جهت هیبریداسیون های تشخیصی.
انجام تست های ایمنی سنجی مبتنی بر رسوب ژلی شامل روش اوشترلونی (Ouchterlony Double Immunodiffusion) و روش سنجش ایمنی انتشار شعاعی (Radial Immunodiffusion - RID) به دلیل ساختار شفاف و بدون تداخل زمینه ای ژل.
سازگاری با متدهای حساس رنگ آمیزی ژل شامل اتیدیوم بروماید (Ethidium Bromide)، سایبر گرین (SYBR Green)، سایبر گلد و سایر رنگ های اینترکالیتور ایمن با کمترین فلورسانس پس زمینه.
انتخاب بافر: از بافر TAE (برای قطعات بزرگ و استخراج دی ان ای) یا بافر TBE (برای قطعات کوچک و زمان اجرای طولانی) استفاده شود.
جهت استعلام موجودی، دریافت سرتیفیکیت آنالیز کیفی (CoA) و خرید آگاروز مخصوص کارهای روتین کد A9539 سیگما آلدریچ در بسته بندی های ۱۰، ۲۵، ۵۰، ۱۰۰، ۲۵۰ و ۵۰۰ گرمی، با بخش فروش مواد و معرف های بیولوژی مولکولی تماس حاصل نمایید.
| # | عنوان ویژگی | مقدار |
|---|
| عنوان/ کد ورژن | توضیحات |
|---|
| عنوان لوازم جانبی | کد لوازم جانبی |
|---|